1813年-1814年的普鲁士解放战争，新成立的普鲁士总参谋部经受住了考验，在作战计划的制定以及战役指挥上发挥了巨大的作用，但是总参谋部的地位仍旧处于非常尴尬的位置，它始终从属于战争部，在职能上也和国王的侍官总署存在一定的重合，总参谋部的地位仍旧需要大大加强，以使其真正在大战略上发挥领导者的作用，将总参谋部创造的任务式指挥方法和‘分进合击“的歼灭战思想融入到整个军队之中。
普鲁士总参谋部
普鲁士总参谋部虽然被赋予了和平时期制定战略进军计划的职责，但是却并没有战时担任最高指挥者的权利，由于总参谋部隶属于战争部，所以总参谋长只是战争部长的顾问，而战争部长才是国王在军事上的首席顾问。1821年，国王首先提高了总参谋长的地位，新的官衔名称是”军队总参谋长“，其地位仅次于战争部长。这意味着总参谋长不再只是总参谋部的参谋长，而是真个军队的总参谋长，这也为总参谋部的独立提供了基础。四年后，总参谋部正式从战争部独立出来，在柏林成立了“军队大总参谋部”，各军团成立了“军队总参谋部”。至此，总参谋长成为仅次于战争部长的国王战略顾问，总参谋部也和战争部、军事内阁（侍官总署）形成了三足鼎立之势。
普鲁士士兵
1864年，以普鲁士和奥地利为首的德意志同盟和丹麦爆发战争，普鲁士总参谋部再度处于一个尴尬的位置，尽管总参谋部负责制定作战计划，但是总参谋长却没能被派往前线指挥作战，作战指令以国王的名义颁布，通过战争部长下达到各军团司令部。战争部也没有向总参谋部反馈足够的前线作战信息，总参谋长只能通过私人的通信来了解前线的局势。显然战争部和总参谋部之间缺乏足够的信息交流，国王必须在战争部和总参谋部之间做出选择，最终国王选择了总参谋部，明确规定了总参谋长的在战争时期的地位，授予其作战指挥权。总参谋部终于取得了战时的作战指挥权，成为了普鲁士军队的精神指导中心，而战争部仅负责和平时期的军队管理工作，一旦战争爆发，则由总参谋部接管军队。
普法战争时期的色当战役
1858年，毛奇将军被正式任命为大总参谋部的参谋长，他的上任对总参谋部产生了深远的影响，最终确立了总参谋部在普鲁士军队中的领导地位，逾越了战争部和军事内阁。当时战争部已经被排到了第三位，只剩下军事内阁和总参谋部有权参与到作战指挥中，而军事内阁的前身是侍官总署，是直属于国王的亲信机构，国王在军事问题上更喜欢听从军事内阁的 意见，而不是总参谋部，军事内阁一度想将总参谋部并入其中。在这场权力争夺中，多亏了毛奇的淡泊名利，他没有将总参谋部卷入 这场纷争中，而是继续从事军事教育以及战略计划的研究，把总参谋部变为一个专门的 军事科学机构。而正是毛奇将军的默默无闻和甘愿奉献精神，赢得了战争部和军事内阁的一致信任，也得到了国王的赏识，从而让总参谋部得到了战争时期的作战指挥权，而毛奇的总参谋部也没有辜负这一信任，相继指挥普鲁士军队取得了对丹麦、奥地利和法国作战的胜利，使普鲁士确立了在德意志各邦国中的绝对领导地位，一个以普鲁士为核心的德意志帝国被创建起来，普鲁士国王威廉一世成为德意志皇帝，德意志民族完成了自己的国家统一。
普鲁士总参谋长毛奇
1870年的普法战争中，普鲁士总参谋部达到了其发展历程中的首次高峰，总参谋部首次以一个整体机构在总体战略上实施指挥，此前总参谋长都是作为前线主力军团的参谋长进行指挥，即便在普奥战争中，毛奇也只是作为国王的军事顾问而参与作战指挥。普法战争中，总参谋部组成三个机动处，分别是，作战处、政治处、和铁道-电报处，包括1名军需总监（相当于副总参谋长）、3个处长和其他6名军官。这个小型总参谋部尽管由于规模有限只能处理一些应急性的事务工作，但是还是使总参谋长能够直接对前线战事进行掌控，对各军团发出指导性的命令。毛奇是任务式指挥方式的坚定拥护者，他相信那些军团、师级参谋部能够很好的领会总参谋部的作战意图，因此给与他们足够的指挥自由，毕竟这些总参谋军官都是由同一个总参谋部培养出来的。在毛奇总参谋长和他的总参谋军官的指挥下，普鲁士军队在色当击败了法军主力并俘虏了法国皇帝，从而使普鲁士军队达到了军事上的巅峰，普鲁士总参谋部也赢得了传奇般的声誉，总参谋部军官被人们称作“神人"（神和人的后代），在普通大众的眼中，总参谋部几乎是无所不能的。
普法战争中普鲁士军队的”分进合击“战术
1871年普鲁士国王威廉一世在法国凡尔赛的大厅里，由德国各诸侯拥戴为德意志皇帝，一个由德国各邦国和自由城市组成的德意志联邦国家正式成立了，所有的联邦军队都要向德意志皇帝宣誓效忠（巴伐利亚除外），这样显然需要一个帝国战争部和帝国总参谋部来统一管理并指挥联邦军队，不过出于政治上的考虑，德意志帝国并没有设立专门的帝国战争部和帝国总参谋部。除普鲁士外，巴伐利亚、萨克森、符腾贝格都保留了自己的战争部和总参谋部，不过鉴于普鲁士在联邦中的绝对领导地位，普鲁士战争部和总参谋部实际上已经在行使帝国战争部和总参谋部的职责。
德皇威廉一世登基
普鲁士大总参谋部担负起帝国总参谋部的角色，成为负责帝国防御任务的最高指导中心， 普鲁士总参谋部和萨克森、符腾贝格总参谋部共同训练参谋军官并定期进行军事交流 ，而通过和巴伐利亚总参谋部进行军队司令官的交换，双方建立了更加密切的关系 。如此尽管德意志帝国没有统一的战争部和总参谋部，但是各邦国军队的训练素质和指挥风格基本上和普鲁士军队一致，一旦发生战争，普鲁士总参谋部将接管整个德意志邦国军队的作战指挥权。
德皇和毛奇、俾斯麦等人商讨局势
普鲁士总参谋部和普鲁士军队所取得的辉煌成就震惊了全世界，各国开始争相研究和效仿普鲁士的总参谋部制度，英国、法国和俄国的总参谋部率先以普鲁士总参谋部为样板进行改组；土耳其、罗马尼亚和希腊也派遣军官到德国总参谋部学习；远在亚洲的中国和日本也聘请德国教官进行执教。普鲁士总参谋部俨然已经成为世界各国总参谋部的榜样！到第一次世界大战爆发，德军总参谋部可以说达到了其顶峰，不仅完全获得了军队的作战指挥权，甚至在政治上也能施加决定性的影响，总参谋长成为了帝国实际的掌控者，但是这一次总参谋部没能为帝国带来最终的胜利，德军总参谋部也不可避免的开始走下坡路。
