据英国路透社1月7日报道，印尼空军发言人法贾尔（Fajar Adriyanto）7日表示，4架F-16战机在纳土纳群岛上空执行了例行巡逻的飞行任务，以保护主权区域。法贾尔还淡化可能与北京发生冲突的担忧，称没有与中国开战的命令。“这些战机正在进行日常巡视，保护我们的主权区域，战机只是偶然飞抵纳土纳群岛上空。”印尼政府指，中国渔船2019年12月中旬在中国海警船护送下，曾驶入印尼纳土纳群岛的专属经济区。印尼外交部为此召见了中国驻印尼大使肖千，表达强烈抗议，并提出了正式抗议照会。印尼总统佐科（Joko Widodo）曾发表措辞强硬的声明说，涉及印尼的主权时，没有谈判余地。

中国外交部发言人耿爽北京时间1月7日表示，北京与印尼已经开通了外交渠道，两国为维护区域和平与稳定承担共同责任。印尼海事安全署主任努沙瓦（Nursyawal Embun）表示，截至1月7日，还没有与中国船只进行任何谈判。另据路透社1月6日报道，印尼政府6日决定，除已派遣军舰赴纳土纳群岛以外，还将动员渔业人员加强对该海域的监控。印尼治安与法律统筹部长马福特（Mahfud MD）告诉记者，印尼将把120名爪哇岛的渔业从业人员派往位于该岛北部、相距1,000海里的纳土纳群岛。

印尼政府上周宣布将向纳土纳群岛周边增加派遣军舰。印尼海上安全机构的官员表示，此前已经派遣了6艘军舰，新增加的4艘军舰正在驶向纳土纳群岛。中国和印尼在纳土纳群岛爆发纠纷是在去年12月，据印尼《雅加达邮报》此前报道称，印尼海事安全局记录，去年12月19日至24日，至少有63起中国渔船进入纳土纳海域非法捕鱼事件，其中数十艘中国海巡舰护卫渔船。而另有多家媒体报道称，印尼当地的渔民在去年12月底又看到一艘中国海巡舰多次护送中国渔船进入当地海域。

纳土纳群岛自古曾是中国管辖区域，岛上生活着数千中国人，但是荷兰殖民者到来后，曾将此地作为殖民地，二次世界大战后，荷兰人被逐出印尼，竟然还将纳土纳群岛交由印尼管辖。到了九十年代初期，东南亚传出这样一则未被证实的传言：纳土纳岛群岛华人代表和中国大陆有过秘密接触，领导人表示在97香港回归后中国会考虑纳土纳岛群岛问题。